Une fois importés et positionnés les éléments à assembler, vous pourriez les sélectionner et les exporter au format OBJ avant de réimporter le fichier OBJ exporté. Mais pour que vous puissiez ensuite changer la couleur des différentes parties de l'objet réimporté, il faut que dès le départ le nom des matériaux dans les éléments soient bien différents.
Mais peut-être qu'il serait plus simple dans votre cas de créer tout simplement un groupe pour ces assemblages.